MTsN 1 Mataram memberikan layanan pembinaan program unggulan dan reguler. Siswa program unggulan akan mendapatkan layanan pembinaan tambahan setiap hari senin – kamis yang dilakukan setelah jam pelajaran Reguler. Biaya pembinaan program unggulan sepenuhnya ditanggung oleh orang tua siswa. Pembinaan program unggulan dikelompokan dalam 3 macam kelas yaitu :

KELAS OLIMPIADE

Diperuntukkan bagi siswa yang ingin mengembakan potensi dalam bidang olimpiade Matematika, IPA atau IPS.

KELAS KEAGAMAAN

Kelas ini iperuntukkan bagi siswa siswi yang ingin mengembangkan potensi dalam bidang keagamaan sperti : Tahfidz, Tafsir, Hadist dan lain-lain.

KELAS PENGAYAAN

Kelas ini diperuntukan bagi siswa siswi yang ingin meningkatkan prestasi akademiknya, yang diharapkan bisa mencapai nila maksimal.